El Instituto de Investigación de Recursos Naturales (IREN-CORFO) es dirigido por Enrique Junemann Mardones, un coronel de Ejército en Santiago. La institución Centroamericana analiza el estado del ambiente y los recursos naturales en 1998, mientras que la Universidad Nacional de Ciencias Forestales y el Instituto Nacional de Conservación y Desarrollo Forestal, Áreas Protegidas y Vida Silvestre están involucrados en proyectos de investigación relacionados con biodiversidad y recursos naturales en Honduras. También se mencionan varias organizaciones y entidades gubernamentales que trabajan en temas ambientales y de recursos naturales en Centroamérica y se hace referencia a una evaluación de impacto ambiental para la región.